新生兒外科專業收治新生兒（包括早產兒）及6個月以內幼嬰各種先天畸形、感染性疾病及腫瘤。表現為嘔吐的常見疾病包括先天性食道閉鎖、先天性肥厚性幽門狹窄、腸旋轉不良、腸閉鎖；表現為腹脹的主要疾病包括肛門直腸畸形、先天性巨結腸；表現為黃疸的疾病如膽道閉鎖，還有一些肉眼即可見的明顯畸形如腹裂、巨型臍膨出、血管瘤、淋巴管瘤、畸胎瘤等等。隨著醫學水平的提高，我們不僅對一些常見的疾病如先天性肥厚性幽門狹窄、腸旋轉不良、腸閉鎖、肛門直腸畸形、先天性巨結腸的治愈率幾乎達到100%，而且開展了大量疑難病、危重病的診治，如巨型臍膨出、膈疝、膽道閉鎖的治療，療效已達國內領先水平。
     近年來已開展的新技術及新項目有：

    1.經肛門I期根治巨結腸：該術式不開腹，對患兒打擊小，創傷輕，恢復快，腹部無創口，住院時間短。
    2.先天性膽道閉鎖擴大肝門肝腸吻合術：該術式打破了膽道閉鎖患兒100％死亡率的鐵門，早期手術可使部分患兒治愈，亦可使部分患兒先存活下來并留下治愈的希望。
    3.腹腔鏡下幽門環肌切開術：我科首創的兩孔法腹腔鏡幽門肌切開術處于國際領先水平，該術式對腹部干擾小，腸功能恢復快，術后半年腹部幾乎無可見瘢痕。
    4.先天性食管閉鎖胸膜外I期吻合術:該術式對胸腔干擾小，呼吸功能恢復快，免去留置胸腔閉式引流管，成活率明顯提高。
    5.腹腔鏡下膽道探查、造影術：表現為嬰幼兒梗阻性黃疸的疾病主要包括膽道閉鎖、膽管發
育不良、膽汁淤積癥及一些遺傳代謝性疾病，這些疾病癥狀相似。治療方法卻不同，臨床常常因為缺少特異性的早期診斷方法而延誤治療。經腹腔鏡行膽道造影與切開腹壁行膽囊造影相比較可減輕對患兒創傷，如能夠明確診斷系膽汁淤積癥、嬰兒肝炎，可不再進行開腹膽道探查術。

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